Ljudet från en mikropump kan huvudsakligen delas in i tre delar: hydrodynamiskt brus, mekaniskt brus från rörliga delar och motorljud.
Hydrodynamiskt brus genereras när mikropumpen är i drift och producerar kontinuerligt tryckpulser i vätskan, vilket exciterar vibrationer i komponenter som pumpkroppen, ventiler och rör, vilket utstrålar buller till utsidan. Enligt mätningar av forskare vid Chengdu Qihai Electromechanical Company är hydrodynamiskt brus den viktigaste bullerkällan i mikropumpar.
Det hydrodynamiska bruset från en mikropump är mellan-till-lågfrekvent brus. När en mikrovakuumpump drar in luft öppnas inloppsventilen och utloppsventilen stängs och drar in luft i pumpkammaren. Detta skapar intensiva tryckfluktuationer i inlopps- och ventilkamrarna, som strålar utåt som ljudvågor och bildar inloppsljud. Inloppsbrus har ett bredbandigt kontinuerligt spektrum och dess grundfrekvens kan beräknas med formeln f=2n/60 (där n är rotationshastigheten per minut). Förutom grundfrekvensen finns det också högfrekventa övertoner, men ljudnivån för dessa övertoner är lägre än grundfrekvensen.
Ju högre rotationshastighet, desto större vakuum, och ju högre flödeshastighet, desto större inloppsljud. Under utblåsningen stänger inloppsventilen och utloppsventilen öppnar, vilket gör att luften expanderar. Luftflödet passerar snabbt genom utloppet, genererar ljudvågor och skapar avgasljud. Avgasljud uppvisar också ett bredbandigt kontinuerligt spektrum. Högre rotationshastighet, tryck och flödeshastighet resulterar i högre avgasljud. Att ansluta ett långt plaströr minskar både inlopps- och utloppsljud. Orsakerna till buller i miniatyrvakuumpumpar är komplexa.
På grund av periodiska tryckfluktuationer i pumpkammaren, genererar instabilt vattenflöde många virvlar. Snabba tryckförändringar på membranet, pumpkammaren och ventilerna, samt friktion mellan vattnet och pumpkroppen, genererar buller. Speciellt när vattentemperaturen är hög och pumpvakuumet är lågt, kan trycket i pumpkammaren under sugslaget vara lägre än det mättade ångtrycket för vatten vid den temperaturen. Detta orsakar vattenförångning, producerar många bubblor och bildar ett komplext två--flöde. Under kompressionsslaget, under högre tryck, kollapsar dessa bubblor snabbt, vilket gör att vatten runt bubblorna rusar mot bubblans centrum med hög hastighet, vilket resulterar i hög-frekvent, hög-slagvattenhammare som kontinuerligt påverkar pumpens inre komponenter.